南京建工科研平臺建設始于2007年，2009年通過省級企業技術中心認定，截至2019年，集團已擁有省級建筑企業技術中心1家、南京市裝配式建筑工程研究中心1家、下設十余家專項研發中心，為省級研究生工作站、國家級博士后工作站。

為了突破企業發展的瓶頸，集團在2013年根據集團整體戰略發展規劃要求，整合現有的研發資源，組建了南京建工集團研究院，與高校、科研院所高度融合、深度合作，作為高校的研究生培養基地聯合研發，在超高性能材料、裝配式建筑、BIM、綠色施工、深基坑等領域打造核心技術，共同打造先進協同研發平臺和高水準學術團隊，實現最大程度上的科研資源共享，為企業轉型升級提供助力。